Partner der GesundheitsUni Jena sind Einrichtungen außerhalb des Universitätsklinikums, die mit der GesundheitsUni Jena zusammen arbeiten.

• Niederösterreichische Patienten- und Pflegeanwaltschaft
• Beschäftigungspakt der Stadt Jena COOP[+]˛
• Thüringer Ministerium für Soziales, Familie und Gesundheit
• IKOS Jena - Beratungszentrum für Selbsthilfe
• Georg Streiter Institut für Pflegewissenschaft
• VdK Sozialverband
• Jenaer Bündnis für Familie
• Landesvereinigung für Gesundheitsförderung Thüringen e.V. - AGETHUR -
• Fachhochschule Jena
• Friedrich-Schiller-Universität Jena
• Stadt Jena, Dezernat für Familie und Soziales
  
  Stand vom Dezember 2010